(一)申請者須先具備以下資格
1. 休漁獎勵金之申請人須為領有特定漁業執照之漁業人，並符合下列條件：其漁船屬活魚運搬船、專營娛樂漁業及漁業權漁業漁船以外之漁船。
2. 休漁獎勵期間為前一年9月1日至每年8月31日止，期間內累積出海作業90日以上及在國內港口休漁90日以上。
(二)休漁獎勵金核發標準
| 漁船別 | 自願性休漁金額（新臺幣元／次） |
| 舢舨 | 9,600 |
| 漁筏(未滿20公尺) | 12,000 |
| 漁筏(20公尺以上) | 15,600 |
| 未滿5噸 | 15,600 |
| 5噸以上未滿10噸 | 18,000 |
| 10噸以上未滿20噸 | 21,600 |
| 20噸以上未滿30噸 | 24,000 |
| 30噸以上未滿40噸 | 27,600 |
| 40噸以上未滿50噸 | 30,000 |
| 50噸以上未滿60噸 | 33,600 |
| 60噸以上未滿70噸 | 36,000 |
| 70噸以上未滿80噸 | 39,600 |
| 80噸以上未滿90噸 | 42,000 |
| 90噸以上未滿126噸 | 45,600 |
| 126噸以上 | 8,000元+(總噸位*300元) |
備註：漁船總噸位超過100噸以上者，總噸位以整數計，小數點部分以四捨五入計算至整數位。
(三)申請人應準備的資料
1. 漁業執照影本一份。
2. 漁船進出港時間明細表或海岸巡防機關提供之漁船進出港資料。
3. 撥款帳戶存摺封面影本一份（帳號應清晰可見）。
4. 印章。
5. 如果委託辦理請被委託人攜帶身分證及印章。
(四)申辦時間及地點
1. 每年5月1日至10月31日。
2. 漁業人向船籍所在地區漁會申辦。
| 服務據點 | 地址 | 電話 |
| 南市區漁會 | 臺南市安平區運河路97號2樓 | 06-2216135 |
| 南市區漁會 | 臺南市運河南街12號 | 06-2222712 |
| 南縣區漁會本會 | 臺南市佳里區進學路240號 | 06-7220391 |
| 北門辦事處 (北門信用分部) | 臺南市北門區鯤江里823號 | 06-7863029 |
| 將軍港辦事處 | 臺南市將軍區平沙里155號 | 06-7930702 |
| 將軍港信用分部 | 臺南市將軍區平沙里1-10號 | 06-7931130 |
| 青山港辦事處 (青山港信用分部) | 臺南市將軍區鯤鯓里50-2號 | 06-7920186 |
| 七股辦事處 (七股信用分部) | 臺南市七股區龍山里210號 | 06-7872132 |
| 永吉信用分部 | 臺南市七股區永吉里51-31號 | 06-7881113 |
| 學甲辦事處 | 臺南市學甲區華宗路139號 | 06-7833918 |
| 蘆竹溝漁港服務處 | 臺南市北門區三光里蘆竹溝333-11號 | 06-7850189 |